成立至今,学院已完成国家863计画课题11项、国家科技支撑计画2项、“十一五”国家重大科学研究计画5项、科技部国际合作重点项目1项、国家杰出青年基金课题1项、国家自然科学基金课题19项以及17项天津市科技攻关项目。至今共承担的国家973计画子课题4项、“十二五”国家重大科学研究计画课题5项(其中1项主持)、国家自然科学基金重点项目1项、国家自然科学基金面上项目12项、教育部科研项目2项、天津市科技计画项目6项及其他项目5项。迄今为止,学院已在国际微生物学权威刊物上发表SCI收录论文161篇,总SCI 影响因子538.614;申请国际发明专利7项,其中3项已获授权;申请国内发明专利160项,其中99项国内发明专利已获授权。2007年以来学院陆续在《美国科学学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,PNAS,影响因子9.598)和《自然》(Nature,影响因子31.434)发表高水平研究论文3篇。另外发表《FEMS Microbiology Reviews》(影响因子9.250)综述论文1篇,《PLoS Pathogens》(影响因子9.079)1篇,《Genome Biology》(影响因子9.036)1篇,《Nucleic Acids Research》(影响因子8.026)1篇 ,《PLoS ONE》(影响因子4.411)6篇,在基因组学和功能基因组学研发领域取得了重大突破。